Новости
РНИМУ 12.11.2020
Молекулярное типирование российских клинических изолятов Neisseria gonorrhoeae 2018-2019 г. выявило связь между аллелями гена penA и генотипами возбудителя гонококковой инфекции.
Проведено исследование фенотипической чувствительности и генетических детерминант устойчивости возбудителя гонококковой инфекции к бета-лактамным антибиотикам (пенициллинам и цефалоспоринам) в современной российской популяции гонококка. Показано, что механизмы формирования устойчивости к разным классам бета-лактамов неидентичны. Обнаружена функциональная зависимость между генотипами гонококка и аллелями гена penA – ключевой детерминаты устойчивости к цефалоспоринам, что важно для мониторинга появления в России штаммов, устойчивых к цефтриаксону – основному препарату для лечения гонореи. В целом, российская популяция гонококка продолжает оставаться чувствительной к цефалоспоринам.
Статья опубликована в журнале Pathogens
WoS
Q1 SJR
ИМБ РАН 06.11.2020
Роль длинной некодирующей РНК LINC00973 в устойчивости раковых клеток к химиотерапии.
Длинные некодирующие РНК (днРНК) определяют устойчивость опухолей к химиотерапии, но механизмы их функционирования не изучены. Нам удалось продвинуться в понимании этих механизмов при изучении днРНК LINC00973, транскрипция которой приводит к переходу опухолевых клеток в состояние «старения». Выполнив нокаут гена LINC00973 с помощью системы CRISPR/Cas9 в линии клеток колоректального рака HT-29, мы обнаружили четырехкратное увеличение чувствительности к действию противоопухолевых препаратов. При этом оказалось, что LINC00973 подавляет деградацию белка р21, который замедляет клеточное деление и активирует восстановление поврежденных участков ДНК. Кроме того, LINC00973 влияет на ранние стадии апоптоза клеток, а также на активность систем репарации ДНК. Таким образом, LINC00973 может служить новой мишенью при разработке более эффективных противоопухолевых препаратов.
Статья опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 03.11.2020
«Читать» геномные данные станет легче.
В России получила официальное свидетельство система клинической обработки геномных данных «VarSiever», предназначенная для врачей-генетиков и позволяющая делать интерпретацию результатов секвенирования на основании клинической картины пациента. Программа обеспечивает проведение быстрой сортировки и фильтрации данных по выбранным параметрам: например, она может ограничить выдачу определенной панели генов с вариантами, имеющими частоту не более заданной. В «VarSiever» есть встроенный набор готовых генетических панелей, можно также создавать свои панели или использование сторонние источники посредством API. В программе предусмотрен интерфейс для создания заметок с привязкой к результатам и подготовка заключений.
Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ №2020663891.
ИМБ РАН 30.10.2020
Новая дрожжевая модель для исследования перспективных противоопухолевых препаратов.
Технологией геномного редактирования с помощью системы CRISPR/Cas9 получены мутантные штаммы пекарских дрожжей Saccharomyces cerevisiae с нарушенной функцией протеасомы – наномашины по разрушению внутриклеточных белков. Оказалось, что в мутантных штаммах повышена активность системы гомологичной рекомбинации за счет сверхэкспрессии гена RAD52 и это делает мутантные штаммы сверхустойчивыми к ДНК-повреждающим соединениям. Подавление экспрессии RAD52 с помощью редактирования генома, CRISPR/dCas9 репрессора или дигидрокумарина делает мутантные штаммы вновь чувствительными к ДНК-повреждающим агентам. Следует отметить, что дигидрокумарин, используемый в пищевой и косметической промышленности, рассматривается как перспективный препарат в комбинаторной терапии опухолей. Он повышает чувствительность опухолей к химиотерапевтическим препаратам (которые в основном являются ДНК-повреждающими соединениями), подавляя гомологичную рекомбинацию. Учитывая сходный механизм действия дигидрокумарина на дрожжи и на опухоли, полученные штаммы могут служить удобной моделью для исследования механизма действия и поиска перспективных противоопухолевых препаратов, нацеленных на подавление гомологичной рекомбинации.
Статья опубликована в журнале International Journal of Molecular Sciences.
WoS
Q1 SJR
ИБГ РАН 10.10.2020
Разнообразие микробиома напитков спонтанного брожения.
Коллектив из ИБГ РАН, компании «Кномикс», Курчатовского института, ФИЦ Биотехнологии и Университета ИТМО проанализировал микробиом пива и сидра спонтанного и смешанного брожения. В выборку вошли большинство сортов данных классов от российских производителей. С помощью высокопроизводительного секвенирования 16S рРНК и ITS было выявлено существенное бактериально-дрожжевое разнообразие. Обработка данных с помощью интерактивной аналитической платформы позволила выявить микробные сигнатуры, ассоциированные с конкретными особенностями рецептуры, а также оценить связь микробиома с метаболомом напитков (на примере органических кислот). Анализ позволил отобрать наиболее перспективные образцы для отработки расширенных вариантов метагеномного анализа. Результаты исследования в будущем помогут повысить воспроизводимость органолептических качеств ферментированных напитков, усовершенствовать микробиологический контроль на производстве, а также выявить микроорганизмы для биотехнологических применений.
Статья опубликована в журнале Food Microbiology.
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 29.09.2020
Российские исследователи раскрыли уникальный механизм регуляции процессов формирования и развития мозга.
Российские исследователи из Центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, куда входят Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Институт биологии гена РАН, РНИМУ им. Пирогова Минздрава России и Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины ФМБА России, совместно с зарубежными коллегами приблизились к пониманию сложных процессов, определяющих развитие нервной системы у эмбриона. С помощью генетически кодируемого сенсора удалось выявить взаимосвязь метаболических и белковых факторов на ранних этапах формирования мозга у рыб. Учёные показали, как содержание метаболически активной молекулы, перекиси водорода, в определенные моменты времени в разных клетках и тканях мозга определяет направленное распространение морфогенетического фактора Engrailed 2, участвующего в ключевых процессах эмбрионального развития у многоклеточных животных.
Статья опубликована в журнале Communications Biology.
WoS
Q1 SJR
ИМБ РАН 22.09.2020
Новая роль мембранного комплекса CydDC в поддержании редокс баланса клетки, окислительном стрессе и толерантности бактерий к аминогликозидным антибиотикам.
Мембранный комплекс CydDC необходим для роста бактерий в условиях низкого содержания кислорода. На протяжении многих лет считалось, что CydDC транспортирует избыточный L-цистеин из цитоплазмы в периплазму, тем самым поддерживая окислительно-восстановительный гомеостаз бактерий. Используя хромосомную инженерию бактерий, мы показали, что основная функция CydDC не связана с транспортом L-цистеина, а заключается в поддержании восстановленного состояния цитоплазматического L-цистеина, что обеспечивает важную взаимосвязь между метаболизмом серы, окислительным стрессом и устойчивостью к антибиотикам. В частности, мы установили важнейшую роль цитоплазматического L-цистеина в токсичности аминогликозидов. Таким образом, понимание механизмов, контролирующих редокс баланс бактерий, может привести к более эффективным стратегиям противодействия устойчивости бактерий к антибиотикам.
Статья опубликована в журнале PNAS.
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 07.09.2020
Сравнительный анализ методов определения репертуара Т-клеточных рецепторов выявил существенные систематические ошибки каждого метода.
Мониторинг репертуара Т-клеточных рецепторов (TCR) в состоянии здоровья и болезни может дать ключевую информацию об адаптивном иммунном ответе, однако, на сегодняшний день, точность методов исследования TCR (секвенирования) оставляет массу вопросов. Сотрудники Центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины приняли участие в работе международного консорциума по системному сравнительному анализу девяти методов секвенирования альфа и бета цепей (структурных элементов) Т-клеточных рецепторов и обнаружили заметные различия в точности и воспроизводимости как в рамках одного метода, так и в сравнении методов друг с другом. В ходе исследования для каждого метода ученые просуммировали значения воспроизводимости, надежности и чувствительности, выявили преимущества и недостатки каждого подхода и на основе различных показателей составили рейтинг протестированных методов, определив наиболее подходящие для разных целей методы (как для выявления максимального разнообразия, так и для точного определения частоты редких клонов).
Статья опубликована в журнале Nature Biotechnology.
WoS
Q1 SJR
ИМБ РАН 12.08.2020
Парадоксальное объяснение ограниченной эффективности анти-TNF терапии.
Анти-TNF терапия ревматоидного артрита совершила революцию в ревматологии. Однако не всегда помнят, что более половины пациентов на нее не отвечают и что у этой терапии есть побочные эффекты. Последнее обстоятельство связано с нарушением защитных физиологических функций TNF. С помощью технологий редактирования генома была создана панель мышей, которая позволила впервые определить, какие клетки продуцируют патогенный TNF в экспериментальном артрите (оказалось – миелоидные клетки), а какие – защитный (оказалось – Т лимфоциты). В первом случае TNF растворимый, во втором – мембранный. Современная системная терапия блокирует как «плохой», так и «хороший» TNF. Вероятно, это и объясняет ее ограниченную эффективность. Статья опубликована в одном из самых престижных журналов в области ревматологии – Annals of Rheumatic Diseases (IF=16).
Статья опубликована в журнале Annals of the Rheumatic Diseases.
WoS
Q1 SJR
ИБГ РАН 29.06.2020
Механизм ингибирования трансляции токсином AtaT2.
Системы токсин-антитоксин широко распространены среди прокариот. Они состоят из двух генов, один из которых кодирует токсин белковой природы, а второй - антитоксин. В стрессовых условиях антитоксин разрушается, высвобождая активный токсин. Эти системы участвуют во множестве различных процессов от поддержания мобильных генетических элементов в популяции бактерий до защиты от фагов. Хотя тысячи различных пар токсин-антитоксин были предсказаны биоинформатически, лишь немногие из них были полностью охарактеризованы экспериментально. В этой работе был описан новый токсин AtaT2 из E.coli O157: H7. Было показано, что он специфически модифицирует заряженную глицил-тРНК, тем самым останавливая биосинтез белка.
Статья опубликована в журнале Nucleic Acids Research.
WoS
Q1 SJR
ИБГ РАН 21.06.2020
Как белки Cas12e режут ДНК?
CRISPR-Cas системы крайне разнообразны: эффекторные Cas белки могут иметь совершенно разную структуру и использовать разные механизмы разрезания ДНК. В этой статье был изучен паттерн разрезания ДНК недавно найденным семейством эффекторов Cas12e (или CasX), также как и Cas12a (Cpf1), разрезающих двунитевые молекулы ДНК за счет одного RuvC домена. Оказалось, что Cas12e белки вносят разрыв неточно, примерно 17-19 нуклеотидов от PAM, образуя короткие, 3-5 нт липкие концы. А длину таких липких 5’-концов можно увеличить, используя направляющие крРНК с короткой спейсерной последовательностью.
Статья опубликована в журнале RNA Biology.
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 11.06.2020
Новые инструменты для изучения молекулярных явлений в живых клетках.
Российские ученые систематизировали данные и провели каталогизацию всего многообразия генетически кодируемых флуоресцентных сенсоров, которые позволяют следить за изменением содержания кислорода в нервных клетках, за работой защитных систем, противостоящих активным формам кислорода, и за обменом веществ в условиях гипоксии мозга. Мозг очень чувствителен к недостатку кислорода. Изучение негативных процессов, которые происходят в нервных клетках при дефиците кислорода, и поиск новых подходов для предотвращения гибели нейронов при гипоксии являются одними из ключевых задач современной нейробиологии. В руках ученых сравнительно недавно появились новые инструменты, которые позволяют изучать такие молекулярные явления в живых клетках. Это генетически кодируемые флуоресцентные сенсоры.
Опубликованная в журнале Antioxidants работа «Genetically Encoded Tools for Research of Cell Signaling and Metabolism under Brain Hypoxia» статья наиболее полно отражает последние достижения в области разработки и применения таких сенсоров на разнообразных моделях гипоксического повреждения мозга.
WoS
Q1 SJR
ИБГ РАН 04.06.2020
Обнаружение ингибитора системы бактериальной защиты BREX
BREX (BacteRiophage EXclusion) – семейство широко распространенных систем защиты от фагов с неустановленным механизмом действия. Подобно классическим системам-рестрикции-модификации, белки BREX метилируют специфические сайты в бактериальном геноме, в то время как отсутствие модификации в геноме бактериофга делает его чувствительным к BREX защите. В данной работе впервые было показано, что фаги могут кодировать белки-ингибиторы, позволяющие им избегнуть имунного ответа BREX системы. В частности, ДНК мимикрирующий белок Ocr бакетриофага T7 способен повлиять как на защиту так и на модификационную активность систмеы BREX из Escherichia coli. Была установлена “мишень” белка Ocr - метилтрансфераза BrxX. Что интересно, белок Ocr также является ингибитором систем рестрикции-модификации I типа и его активность против BREX предполагает наличие схожих свойств у активных комплексов этих систем.
Статья опубликована в журнале Nucleic Acids Research.
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 28.05.2020
РНИМУ им. Н.И. Пирогова наведет порядок в учете медицинских анализов.
Разработанная РНИМУ им. Н.И Пирогова электронная система «O’Gelis Storage» позволит организовать и автоматизировать пробоподготовку, обеспечит прослеживаемость образцов на всех стадиях от принятия биоматериала до выдачи результата исследования. Она также автоматизирует процессы регистрации образцов, фиксирования данных по каждой стадии, позволит производить автоматические расчёты преаналитических данных для минимизации возникновения ошибок, сбор статистики по потоку образцов, учёт расхода реагентов и его прогнозирование. Кроме того, она обеспечит разграничение прав доступа к данным и функционалу, а также предоставит интерфейс для удалённого менеджмента процессов.
Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ №2020615669.
ФНКЦ ФХМ ФМБА 23.05.2020
Белки, необходимые для синтеза РНК в раковых клетках, узнают ДНК необычной геометрии.
Сотрудники центра показали,  что  на транскрипцию в раковых клетках могут влиять фрагменты ДНК необычной геометрии – четверные спирали. Для поддержания нормального синтеза РНК полимераза должна легко преодолевать ‘барьер’ из белков, на которые намотана геномная ДНК (гистонов). В этом помогают белки-переносчики  (шапероны гистонов). В раковых клетках общий уровень транскрипции высок, и шапероны гистонов особенно значимы, что делает их удобными терапевтическими мишенями.  Коллективу ФНКЦ ФХМ удалось получить четверные ДНК-спирали, способные узнавать и удерживать шапероны гистонов. В их числе оказалась уже известная молекула, показавшая ранее противоопухолевую активность. В дальнейшем на основе четверных спиралей ДНК могут быть получены новые химиотерапевтические препараты, но прежде требуется решить проблему их внутриклеточной доставки [Pavlova et al., Int. J. Biol. Macromol 2020].
Статья принята к публикации в журнал «International Journal of Biological Macromolecules».
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 16.04.2020
Ученые обнаружили, что иммунные клетки (Т-лимфоциты), которые активируются в ответ на попадание распространенного аллергена (никеля) в организм, часто несут вариант гена TRAV9‐2 либо содержат аминокислоту гистидин в составе участка, распознающего антиген.
Никель является наиболее частой причиной Т-клеточного аллергического контактного дерматита. Сотрудники Центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины приняли участие в работе команды ученых, нацеленной на исследование никель-специфичных Т-клеточных рецепторов (TCR). Для этой работы был задействован новый метод точного и количественного выявления активируемых CD4+ Т-лимфоцитов, а также современный метод анализа разнообразия Т-клеточных рецепторов. Оказалось, что среди никель-специфичных Т-клеточных рецепторов особенно часто встречаются варианты, экспрессирующие определенный генный сегмент - TRAV9-2 - либо гистидин в антиген-распознающей области. Предложенный подход может быть распространен и на другие контактные аллергены, и может быть задействован для разработки диагностических тестов. В целом, эта работа открывает потенциал использования новых методов диагностики, а в будущем и терапии аллергического контактного дерматита.
Результаты исследований опубликованы в журнале «Allergy»
WoS
Q1 SJR
ФМБА 06.04.2020
Исследование меж- и внутриопухолевой гетерогенности глиобластом с помощью TOF-SIMS
Сотрудники Центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России совместно с коллегами из других российских институтов разработали методику, позволяющую одновременно определять распределение белков и метаболитов в ткани глиомы с пространственным разрешением 800 нм, что позволяет различать отдельные участки опухоли, а также визуализировать границу опухоли с нормальными тканями. Глиобластома представляет собой один из наиболее агрессивных видов рака человека со средней выживаемостью менее двух лет. Отличительной патологической особенностью глиобластом является их высокая степень меж- и внутриопухолевой неоднородности. Межопухолевая гетерогенность глиобластом широко исследовалась на геномном, метиломном, транскриптомном, протеомном и метаболомном уровнях. Однако из-за отсутствия методов, позволяющих анализировать образцы глиобластом с высоким пространственным разрешением, лишь несколько исследований описывают внутриопухолевую гетерогенность. В данном исследовании была применена TOF-SIMS (времяпролетная масс-спектрометрия вторичных ионов) для анализа отдельных клеток и клинических образцов: парафиновых срезов опухолей, полученных от 57 пациентов. Была разработана методика, позволяющая одновременно определять распределение белков и метаболитов в ткани глиомы с пространственным разрешением 800 нм. По данным TOF-SIMS образцы глиомы можно разделить на клинически значимые группы и отличить от нормальной ткани мозга. Кроме того, с помощью TOF-SIMS были выявлены различия между морфологически разными участками глиобластом в пределах одной и той же опухоли. С помощью окрашивания срезов глиобластом антителами против Caveolin-1, конъюгированными с золотом, была визуализирована граница между некротической и пролиферирующей зонами опухоли, кроме того, образцы глиом разделялись на группы, характеризующиеся разной выживаемостью пациентов. Наконец, было продемонстрировано, что в глиобластомах присутствуют клетки, которые характеризуются высоким уровнем белка Caveolin-1 и холестерина. Эта популяция может частично представлять собой стволовые клетки глиомы. В совокупности эти результаты показывают, что предложенный метод позволяет анализировать ткани глиомы с пространственным разрешением, недоступным для большинства других омиксных подходов, и полученные данные могут быть использованы для прогнозирования клинического поведения опухоли.
Статья опубликована в журнале Molecular & Cellular Proteomics
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 28.02.2020
Российскими учеными создан сверхъяркий генетически кодируемый флуоресцентный сенсор для детектирования ионов кальция в живых клетках.
Как известно, ионы кальция опосредуют передачу разнообразных сигналов внутри клетки и участвуют в регулировании множества процессов от клеточного движения и транскрипции генов до секреции важных биомолекул и передачи нервных импульсов. Регистрация изменений внутриклеточного кальция используется для исследования функциональной активности разнообразных клеток. Российские ученые создали новый сверхъяркий генетически кодируемый флуоресцентный сенсор NCaMP7 для детектирования динамических изменений кальция в живых клетках. Он ярче наиболее часто используемого для этих целей флуоресцентного сенсора GCaMP6s примерно в 1.7 раза. Оптические характеристики нового сенсора позволяют использовать его для регистрации активности нервных клеток в мозге грызунов в условиях свободного поведения.
Результаты исследований опубликованы в International Journal of Molecular Sciences.
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 21.02.2020
Первичный и вторичный Т-клеточный ответ на вирусную инфекцию драматически различаются по динамике и амплитуде.
Огромное разнообразие Т-клеточных рецепторов (TCR) позволяет иммунной системе подобрать антиген-распознающие варианты для защиты от новой инфекции. Сотрудники Центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины применили методы анализа транскриптомов единичных Т-лимфоцитов, а также современные методы анализа репертуара Т-клеточных рецепторов, для того чтобы отследить динамику пролиферации (деления клеток) и сокращения численности вирус-специфичных Т-лимфоцитов при первичной и повторной вирусной инфекции. Работа велась на добровольцах, получавших живую вакцину желтой лихорадки - модели, имитирующей острую вирусную инфекцию у людей. Было показано, что вторичный ответ на порядок слабее, но при этом примерно на 10 дней быстрее первичного. Кроме того, были найдены характерные группы вариантов Т-клеточных рецепторов, специфичные к антигенам желтой лихорадки.
Результаты исследований опубликованы в биомедицинском журнале «eLife».
WoS
Q1 SJR
ИБГ РАН 03.02.2020
Разработан улучшенный метод детекции новых спейсеров в CRISPR-кассете.
Системы CRISPR-Cas обеспечивают защиту прокариот от бактериофагов посредством встраивания коротких фаговых последовательностей – спейсеров – в CRISPR-кассету в геноме клетки. Это позволяет клеткам оперативно распознать вирус при повторных заражениях. Для детектирования новых спейсеров используют ПЦР с праймерами к участкам, фланкирующим сайт встраивания спейсера. Появление удлинённого продукта ПЦР свидетельствует о появлении нового спейсера. Поскольку формирование иммунитета происходит с низкой эффективностью, в ПЦР всегда присутствует короткий продукт, соответствующий исходной CRISPR-кассете. Стандартная ПЦР не позволяет детектировать спейсеры, интегрированные менее чем в 5% CRISPR-кассет. В статье предложена супПЦР (супрессорная ПЦР) с чувствительностью, превосходящей чувствительность стандартного метода в 10 раз.
Статья опубликована в журнале Biochemical Society Transactions.
WoS
Q1 SJR
ИМБ РАН 22.01.2020
Обнаружены генетические маркеры устойчивости возбудителя туберкулеза к новейшему противотуберкулезному препарату бедаквилин.
Бедаквилин – единственный противотуберкулезный препарат, разработанный и внедренный в клиническую практику за последние 25 лет. Сегодня бедаквилин является последней линией терапии туберкулеза, поэтому чрезвычайно важно установить механизмы развития устойчивости микобактерии к данному препарату. С использованием образцов возбудителя туберкулеза от пациентов, получавших терапию бедаквилином, и больных контрольной группы, установлены генетические детерминанты устойчивости к бедаквилину. Показано, что мутации в гене mmpR микобактерии формируют устойчивость низкого уровня к данному препарату, что свидетельствует о возможности назначения пациентам терапии повышенными дозами бедаквилина. В то же время, мутации в гене atpE, кодирующем С-субъединицу АТФ-синтазы, ассоциированы с высоким уровнем устойчивости к бедаквилину, и лечение туберкулеза будет неэффективным. Результаты исследования формируют новые критерии схем терапии лекарственно-устойчивого туберкулеза в России и в мире.
Результаты исследований опубликованы в Journal of Infection.
WoS
Q1 SJR
ИМБ РАН 21.01.2020
В российской популяции возбудителя гонореи доминируют поддающиеся лечению антибиотиками формы.
Российскими учеными проведено масштабное исследование молекулярной эволюции возбудителя гонореи в России. Проанализировано 804 изолятов Neisseria gonorrhoeae , собранных в 17 регионах Российской Федерации (7 из 8 федеральных округов) в 2013 – 2018 г. Выявлены наиболее распространенные в РФ варианты, обнаружены генетические маркеры, ассоциированные с устойчивостью возбудителя к актуальным антибиотикам. Обнаружено только 3 изолята (0,4%) пандемически значимого типа 1407, характеризующегося множественными детерминантами резистентности к антимикробным препаратам и доминирующего во многих странах ЕС, США, Японии, Австралии. Филогенетический анализ изолятов показал генетическую отдалённость наиболее распространенных российских и европейских сиквенс-типов, что указывает на локальный характер формирования и эволюции российской популяции возбудителя гонококковой инфекции. Полученные данные свидетельствуют о благоприятной эпидемиологической обстановке с заболеваемостью и распространенностью гонореи в России.
Результаты исследований опубликованы в International Journal of Infectious Diseases.
WoS
Q1 SJR
ИБГ РАН 16.01.2020
Характеризация нового Cas9 белка из бактерии Clostridium cellulolyticum.
CRISPR-Cas системы – это защитные системы прокариот, которые сегодня широко применяются в биотехнологии для изменения генома различных организмов от человека до растений. Их работа основана на Cas белках, которые в комплексе с направляющими РНК могут быть направлены на любой сайт генома для его модификации. В этой работе была охарактеризована CRISPR-Cas система из промышленно-значимой бактерии, Clostridium cellulolyticum, организма, способного разлагать лигноцеллюлозу (компост, сено и т.п.) в биотопливо. Оказалось, что система является активной, а эффекторный белок, малоразмерный CcCas9, эффективно режет ДНК, фланкированную короткой PAM последовательностью NNNNGNA. Теперь CRISPR-CcCas9 может найти применение в биотехнологии: например, для модификации генома своего полезного хозяина, бактерии Clostridium cellulolyticum.
Статья опубликована в журнале Nucleic Acids Research.
WoS
Q1 SJR
РНИМУ 13.12.2019
Российские исследователи предложили метод борьбы с одним из самых смертельных видов злокачественных опухолей.
Российские исследователи из Центра высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, в который входят Институт молекулярной биологии им. В.А.Энгельгардта РАН, Институт биологии гена РАН, РНИМУ им.Пирогова Минздрава России и Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины ФМБА России, предложили концепцию лечения немелкоклеточного рака легкого за счёт активации онкосупрессорной активности CTDSP-фосфатаз. Фосфатазы CТDSP1, CTDSP2 и CTDSPL участвуют во многих жизненно важных клеточных процессах и в последнее время привлекают особое внимание, поскольку их роль при НМРЛ по-прежнему недостаточно ясна. Идентификация онкосупрессоров со схожими свойствами и функциями, участвующих в механизмах защиты клеток легкого от злокачественной трансформации, является перспективным направлением онкогеномики и важна в разработке новых терапевтических стратегий при немелкоклеточном раке легкого.
Результаты исследования опубликованы в британском журнале «Bioscience Reports»
WoS
Q1 SJR